Transcripción inversa del ARN del SARS-CoV-2 e integración en el genoma humano

Publié par Contra información sur 10 Avril 2021, 15:41pm

Un estudio, que pasó desapercibido para el público en general, publicado el 13 de diciembre de 2020, tiende a demostrar que el virus SARS-CoV-2 es capaz de realizar una retrotranscripción que modificaría el ADN del paciente infectado. Esto explicaría por qué los pacientes ya infectados y curados siguen excretando ARN viral semanas y meses después. La extrañeza de este virus no deja de sorprender y asombrar.

La redacción de E&R ha traducido el resumen y la introducción de este largo estudio, para ponerlos a disposición de sus lectores y del público en general.

Cabe destacar que el sitio bioRxiv, consciente del carácter muy sensible de la información que puede aparecer en sus columnas, en particular sobre el tema de Covid19, se ha visto obligado de advertir que nos parece bienvenida en el sentido de que se trata de un tema muy técnico y que no debe prestarse a las teorías confusas, pero que tampoco se debe ignorar:

bioRxiv recibe muchos artículos nuevos sobre el coronavirus SARS-CoV-2. Un recordatorio: se trata de informes previos a la impresión que no han sido revisados por pares. No deben considerarse concluyentes, ni deben guiar la práctica clínica o el comportamiento en materia de salud, ni deben aparecer en los medios de comunicación como información establecida.

Los redactores de este estudio son:
Liguo Zhang
Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA

Alexsia Richards
Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA

Andrew Khalil
Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA
John A. Paulson School of Engineering and Applied Sciences, Harvard University, Cambridge, MA, USA
Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering, Harvard University, Cambridge, MA, USA

Emile Wogram
1Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA

Haiting Ma
Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA

Richard A. Young
Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA
Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA

Rudolf Jaenisch
Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA

Resumen:

La excreción prolongada de ARN del SRAS-CoV-2 y la recurrencia de los tests positivos de PCR han sido ampliamente notificados en pacientes después de la recuperación, a pesar de que estos pacientes son en su mayoría no infecciosos. Hemos estudiado la posibilidad de que los ARN del SARS-CoV-2 pueden ser objeto de una transcripción inversa e integrarse en el genoma humano y que la transcripción de las secuencias integradas podría explicar los tests de PCR positivos.

En apoyo de esta hipótesis, hemos encontrado transcripciones quiméricas constituidas por secuencias víricas fusionadas con secuencias celulares en los conjuntos de datos publicados de células cultivadas infectadas por el SARS-CoV-2 y de células primarias de pacientes, lo que corresponde a la transcripción de secuencias víricas integradas en el genoma.

Para corroborar experimentalmente la posibilidad de una retrointegración viral describimos las pruebas que los ARN del SARS-CoV-2 pueden ser transcritos de manera inversa en las células humanas por la transcriptasa inversa (RT) a partir de elementos LINE-1 o por la RT del VIH-1, y que estas secuencias de ADN pueden integrarse en el genoma celular y ser transcritas posteriormente.

La expresión endógena humana de LINE-1 ha sido inducida tras la infección por el SARS-CoV-2 o por la exposición a citoquinas en células en cultivo, lo que sugiere un mecanismo molecular de retrointegración del SARS-CoV-2 en los pacientes. Esta nueva característica de la infección por el SARS-CoV-2 puede explicar por qué los pacientes pueden seguir produciendo ARN viral después de la recuperación y sugiere un nuevo aspecto de la replicación del virus de ARN.

Introducción

Se han notificado tests de PCR positivos continuos o recurrentes para el SARS-CoV-2 en pacientes semanas, o meses después de la recuperación de la infección inicial. Aunque recientemente ha sido señalada la reinfección de buena fe del SARS-CoV-2 después de la recuperación, los estudios de cohorte con puesta en cuarentena estricta de los sujetos recuperados del COVID-19 han sugerido que los casos de nuevos positivos no se debieron a la reinfección. Además, ningún virus capaz de replicarse ha sido aislado o propagado a partir de estos pacientes positivos de PCR.

La causa de esta producción prolongada y recurrente de ARN viral es desconocida. Como virus de ARN de cadena positiva, el SARS-CoV-2 y otros beta-coronavirus como el SARS-CoV-1 y el MERS utilizan un ARN polimerasa dependiente de ARN para replicar su ARN genómico y transcribir sus ARN subgenómicos. Es posible que los ARN del SARS-CoV-2 se transcriban de forma inversa y se integren en el genoma humano, y que la transcripción de las copias de ADN integradas sea la responsable de los test de PCR positivos.

Una actividad endógena de la transcriptasa inversa (TI) se ha observado en las células humanas, y se ha demostrado que los productos de la transcripción inversa se integran en el genoma. Por ejemplo, se ha demostrado que las transcripciones del APP se transcriben de forma inversa mediante RT endógena, y los fragmentos de APP resultantes se integran en el genoma de las neuronas y se transcriben. Los elementos LINE-1 humanos (alrededor del 17% del genoma humano), un tipo de retrotransposones autónomos, son una fuente potencial de RT endógena, capaz de retrotransponerse a sí misma y a otros elementos no autónomos como Alu.

El artículo científico completo: bioRxiv.

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